De onderzoekers in Karolinska Institutet hebben een methode voor snel, goedkoop, nog het nauwkeurige testen voor besmetting covid-19 ontwikkeld. De methode vereenvoudigt en bevrijdt het testen van dure reactiestappen, toelatend het upscaling van de diagnostiek. Dit maakt de methode bijzonder voor plaatsen en situaties met beperkte middelen aantrekkelijk. Het is even interessant voor het herhaalde testen en voor het bewegen van middelen van dure diagnostiek aan andere delen van de zorgketen. De studie wordt gepubliceerd in Aardmededelingen.

„Wij begonnen aan de kwestie te werken van het ontwikkelen van een dadelijk beschikbare testmethode zodra wij de ontwikkelingen in Azië en zuidelijk Europa zagen, en alvorens de situatie crisispunt in Zweden bereikte,“ belangrijkste onderzoeker Bjorn Reinius, onderzoekleider bij het Ministerie van Medische Biochemie en Biofysica in Karolinska Institutet zegt. „Onze methode werd effectief gebeëindigd reeds tegen eind April, en wij maakten toen alle gegevens online vrij beschikbare.“

De verspreiding van nieuwe coronavirus aan het eind van 2019 in het gebied van Wuhan van China steeg snel in globale pandemic. Het vrij hoge transmissietarief en het grote aantal niet-symptomatische besmettingen leidden tot een reusachtige, wereldwijd behoefte aan snelle, betaalbare en efficiënte diagnostische tests die in klinische evenals niet klinische montages zouden kunnen worden uitgevoerd.

De gevestigde diagnostische tests voor covid-19 zijn gebaseerd op de opsporing van de virale steekproeven van de RNAintern verpleegde patiënt, zoals neus en keelzwabbers, waarvan de RNAmolecules dan worden gehaald en moeten worden gezuiverd. De RNAreiniging vormt een belangrijk knelpunt voor het testende proces, die heel wat materiaal en logistiek evenals dure chemische samenstellingen vereisen.

Het maken van de huidige methodes eenvoudiger zonder hun nauwkeurigheid duidelijk te compromitteren betekent dat meer en het snellere testen kunnen worden uitgevoerd, die zouden helpen om het tarief van transmissie te verlagen en vroeg-stadiumzorg te vergemakkelijken.

Het dwars-departementale onderzoeksteam in Karolinska Institutet heeft nu methodes ontwikkeld die volledig de RNA-Extractie procedure omringen, zodat zodra de geduldige steekproef door middel van het verwarmen buiten werking is gesteld, besmettelijk makend de virusdeeltjes niet meer, het rechtstreeks tot de kenmerkende reactie kan overgaan die de aanwezigheid van het virus ontdekt.

Volgens de onderzoekers, zijn de belangrijkste sleutels tot het succes van de methode zowel de bovengenoemde procedure van de virusinactivering als een nieuwe die formulering van de oplossing wordt gebruikt om het steekproefmateriaal te verzamelen en te vervoeren die uit de patiënten wordt genomen.

„Door de inzamelingsbuffer met eenvoudige en goedkope bufferformuleringen te vervangen, kunnen wij virale opsporing met hoge gevoeligheid direct van de originele klinische steekproef, zonder enige middenstappen toelaten,“ zegt Dr. Reinius.

De instellingen en de onderzoeksteams rond de wereld hebben duidelijke belangstelling in de methode getoond aangezien een eerste versie van het wetenschappelijke artikel op de voordrukserver medRxiv werd gepubliceerd. Het artikel werd gelezen meer dan 15.000 keer zelfs alvorens het door andere onderzoekers op het gebied werd peer-herzien en officieel in Aardmededelingen werd gepubliceerd.

„Dankzij de lage kosten en de eenvoud van de methode, wordt het een bijzonder aantrekkelijke optie bij plaatsen en in situaties met beperkte middelen maar een dringende behoefte om voor covid-19 te testen,“ hij zegt en voegt toe: „Ik zou zeker willen zien dat deze die test in Zweden, bijvoorbeeld voor het goedkope periodieke testen van niet-symptomatische mensen ook wordt gebruikt om de verspreiding van besmetting te elimineren.“

De studie werd gesteund door toelagen van de Wallenberg-Stichtingen via SciLifeLab/KAW Nationaal Onderzoeksprogramma covid-19 en van Ragnar Soderberg Foundation.

Publicatie: „Massieve en snelle covid-19 die zijn uitvoerbaar door extractie-vrije rechts-PCR SARS-CoV-2“ testen. Ioanna Smyrlaki *, Martin Ekman *, Antonio Lentini, Nuno Rufino de Sousa, Natali Papanicoloau, Martin Vondracek, Johan Aarum, Hamzah Safari, Medicijnman Muradrasoli, Antonio Gigliotti Rothfuchs, Jan Albert, Bjorn Hogberg en Bjorn Reinius #. (*equal bijdrage, # overeenkomstige auteur)

Aardmededelingen, online 23 September 2020, doi: 10.1038/s41467-020-18611-5.